馬來西亞政府9月1日宣布，7日起將禁止印度、印度尼西亞和菲律賓三國持有馬來西亞長期通行證的人員入境。 受限人群包括這三國公民中持有馬來西亞永久居留證者、第二家園計劃參與者、持有EP1工作准證者(一般授予高月薪且有長期雇傭合同者)、持有專業人士通行證者、持有居留證的本地公民配偶子女以及留學生簽證持有者。 馬來西亞國防部長伊斯梅爾表示，馬來西亞政府正在密切觀察全球疫情狀況，如其他國家出現新冠肺炎病例迅速增加的情況，也會考慮對相關國家實施同樣限制。